Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F11rO88792 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F11rO88792 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F11rO88792 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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