Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tom1O88746 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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