Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms