Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtssO70370 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtssO70370 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtssO70370 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtssO70370 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms