Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Supt5hO55201 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms