Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tlx3O55144 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tlx3O55144 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tlx3O55144 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tlx3O55144 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tlx3O55144 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tlx3O55144 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tlx3O55144 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tlx3O55144 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tlx3O55144 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tlx3O55144 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tlx3O55144 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms