Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26a1O55127 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms