Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap2O55126 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms