Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copb2O55029 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms