Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BckdkO55028 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdkO55028 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdkO55028 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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BckdkO55028 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BckdkO55028 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BckdkO55028 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BckdkO55028 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BckdkO55028 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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