Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms