Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnxbO35452 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TnxbO35452 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TnxbO35452 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TnxbO35452 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TnxbO35452 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TnxbO35452 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TnxbO35452 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TnxbO35452 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TnxbO35452 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TnxbO35452 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TnxbO35452 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TnxbO35452 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TnxbO35452 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TnxbO35452 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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