Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-ObO35424 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-ObO35424 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-ObO35424 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms