Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms