Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmd4O35226 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms