Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms