Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NumblO08919 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NumblO08919 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NumblO08919 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NumblO08919 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NumblO08919 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NumblO08919 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NumblO08919 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NumblO08919 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NumblO08919 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumblO08919 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumblO08919 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumblO08919 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumblO08919 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumblO08919 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms