Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms