Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms