Protein–RNA interactions for Protein: J3QJU9

Gm21886, Predicted gene, 21886, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21886J3QJU9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm21886J3QJU9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21886J3QJU9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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