Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20830J3KML6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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