Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms