Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms