Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcf11G3X9Z4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms