Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nccrp1G3X9C2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms