Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms