Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms