Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms