Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D430041D05RikF6ZGR6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms