Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm42421F6X8D5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42421F6X8D5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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