Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8247F6VRJ8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms