Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms