Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cald1E9QA15 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms