Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd35E9Q9D8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd35E9Q9D8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms