Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms