Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpfE9Q3P4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpfE9Q3P4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms