Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms