Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms