Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf11E9PZM7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms