Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd1E9PZ26 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms