Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh10E9PXQ7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh10E9PXQ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms