Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgaE9PV24 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FgaE9PV24 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms