Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd5D6MZJ6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd5D6MZJ6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms