Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn2r49D3Z6L3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms