Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf217D3YYI7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms