Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms