Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cttnbp2B9EJA2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms