Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Abcc8B2RUS7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms