Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms