Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

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Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PtprbB2RU80 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PtprbB2RU80 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PtprbB2RU80 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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